Неку очнулся в центре Токио и все, что он помнит — это необходимость выполнять указания, чтобы не быть стертым. Ему составляет компанию Шики — незнакомая девчонка — таково было начало истории в первой части игры The World Ends with You. В продолжении Neo: The World Ends with You игрок сможет управлять несколькими персонажами, использовать более трехсот способностей для борьбы с Шумом — главным противником мира игры.